发布时间:2024-05-27 17:49:26 - 更新时间:2024年06月29日 15:22
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送样要求
一、从组织分离单细胞,要求是新鲜的组织,没有经过冷冻、固定等处理。
二、保证细胞活性和形态完整,不要损伤细胞。
三、分离的单细胞放入公司提供的裂解液中,使用干净的核酸酶的96孔板或200µl的八连排PCR管,每管/每孔裂解液用量为2.55µl,放入细胞时带入缓冲液体积不要超过0.5µl。
四、细胞数量:每管/每孔放入一个细胞,每种细胞建议至少取5个细胞做重复。【细胞分群,每种类型细胞至少5个,要看最关心的细胞类型所占比例,比如目标细胞占比5%的话就需要测100个细胞。】
五、单细胞放入裂解液后,-80℃保存,干冰运输。运输的时候要将管子做好包装,放入干冰中,以防运输过程中管子损坏。
六、裂解液-80℃保存,避免反复冻融。
七、操作过程尽量保持低温环境,加入单细胞的裂解液尽快放入-80℃保存,最好不要 超过1小时,中间的时间越短越好。
八、样本一旦放在-80℃或干冰冻存之后,不能反复化冻。
分析结果主要包括:数据质控、参考基因组比对、基因表达分析、主成分分析(PCA)、tSNE、聚类、GO和KEGG分析、最小生成树等。
测序数据质量汇总
测序质量图
参考基因组序列比对
基因表达分析
主成份分析
tSNE1分析图
标记基因在不同细胞群的表达
最小生成树
聚类分析
GO和KEGG分析
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